日本的總人口高達1億2千7百多萬，全世界排名第10
人口眾多，加上高度都市化，因此產生了不少人口百萬以上的大都市
截至2009年底為止，日本一共有12個百萬大城，如下表：

法定人口是2005年國勢省所做的調查
推計人口是各地方政府根據法定人口再加減每個月的出生死亡、遷入遷出，且包含外國人登錄數，更能反映現在的情況
此表的推計人口數值是2010年3月1日的資料，只有札幌是2009年12月31日的資料

這些百萬大城中，有4個位在關東，3個在關西，其它北海道、東北、中部、中國、九州各1個
除了川崎市外，每一個都是該一級行政單位（都道府縣）的縣廳（或府廳、道廳）所在地
因為川崎市所在的神奈川縣還有個橫濱市老大哥，而神奈川縣也是唯一有兩個百萬大城的一級行政單位

1. 東京特別區部：
日本事實上並沒有「東京市」這個行政單位，通常會以「東京都」轄下的23個特別區（相當於二次大戰前的東京市）來代表東京市這個概念。光這23個區的人口就高達800多萬，比台北縣市的總和還要多。東京特別區部的人口不但最多，人口密度亦是最高，每平方公里達14151人，比台北市和高雄市都還要高。

2. 橫濱市：
位在東京旁邊的橫濱市是日本第1大港。橫濱在1942年人口突破100萬，並受惠於戰後京濱工業地帶的高度成長，人口也跟著急速增加。之後因為日本東京一極集中，全日本各地的資源流入東京都會區，橫濱也順勢在1978年超越大阪一舉成為第2大城。

3. 大阪市：
印象中大阪是日本第2大都市，其實這是以都會區而言（橫濱算在東京都會區）。單以「市」的人口來看，大阪的人口比橫濱少了100萬，和台北市差不多。不過大阪的人口密度比橫濱多出不少，也就是說，大阪是輸在「面積」比較小。

4. 名古屋市：
名古屋是整個中部地方最大的都市，在1935年突破100萬人口，1969年超越200萬。人口成長主要是來自中京工業地帶的發展，這裡有個三菱汽車和全世界最大的汽車公司Toyota，使得中京工業地帶已連續29年成為全日本出口額最多的區域。

5. 札幌市：
札幌是北海道最大的都市，在1970年突破100萬人口。且因為日本是島國，主要的城市都臨海，札幌是少數的內陸大城。札幌市的面積很大，跟彰化縣或桃園縣差不多，因此人口密度並不算高。要注意的是，雖然札幌的人口持續成長，但整個北海道的人口卻是在減少中。

6. 神戶市：
神戶早在1939年人口就突破100萬，當時比橫濱、札幌都還多。雖然行政區面積不小，但是山地多，實際上可居住的地方有限，發展到150萬的人口算是很飽和了。神戶市的人口跟高雄市差不多。

7. 京都市：
京都曾經作為日本的首都1000多年，人口自然不會太少。只是進入近代後其它地區大量發展重工業，京都因為古蹟太多，限制了它的發展。1932年人口突破100萬，1980年代來到史上的高峰148萬人，之後就停止成長甚至有微幅滑落。

8. 福岡市：
福岡是九州最大的都市，也是九州地方的經濟、行政、交通、文化中心，工商業都很發達。在1975年突破100萬人口，之後持續快速成長，超越京都是遲早的事，甚至連神戶都岌岌可危。

9. 川崎市：
川崎是夾在東京和橫濱中間的一個狹長都市，因為地利，吸引了很多工作在東京的人定居，1974年突破100萬人口。川崎市的面積很小，居日本各大都市的末位，因此人口密度高達每平方公里將近1萬人。川崎純粹就是「人很多」，缺少特殊的觀光景點，因此對台灣人來講應該是最沒存在感的日本大都市。

10. さいたま市：
さいたま市是日本人口前50位的都市中唯一以平假名當正式名稱的都市，但因為さいたま念起來的音和「埼玉」一樣，所以中文資料通常會以「埼玉市」表示。さいたま市的年紀很輕，來自2001年東京北邊的埼玉縣浦和市、大宮市、与野市3個都市的合併，一誕生就是個人口超過110萬的大城。

11. 廣島市：
廣島是中國地方最大的都市，在1985年因合併周圍市町而躍過100萬人口。雖然面積有900平方公里，但是山多平地少，發展幾近飽和，近15年來成長稀少。

12. 仙台市：
仙台是東北地方最大的都市，估計在1999年突破100萬人口。但因為整個日本的人口成長已趨緩，東北地方更是持續減少，可預見未來仙台市的人口也很難大量增加。

除了這12個外，目前還有2個人口90多萬的百萬大城候選城市
第1個是福岡縣的北九州市，法定人口993,525，但是推計人口反而跌至982,319
事實上，北九州市在1980年代曾高達106萬人，之後因產業的移出與衰退，人口跟著一路下滑

第2個是千葉縣的千葉市，法定人口924,319，推計人口956,682
雖然比北九州市略少，但以整個東京都會區強勁的成長力道來看，很快就會超越北九州市進而突破100萬人口